贛南醫科大學第一附屬醫院創建于一九四二年，經歷了由小到大，由大到強的發展歷程。至二〇一〇年底，占地208畝，總資產6.14億元，業務總收入4.3億元。設有30個臨床科室，12個醫技科室， 4個實驗室，1個臨床醫學研究中心，1個臨床技能實驗中心。醫院堅持以病人為中心，以質量為核心，內強素質、外樹形象，形成了以“質量建院、科技興院、人才強院、品牌揚院、形象立院”的發展戰略。醫院先后榮獲“全國五一勞動獎狀”、“全國衛生系統先進集體”、 “全國衛生系統紀檢監察先進單位”、 “江西省五一勞動獎狀”、“2008—2010年全省衛生服務能力建設工程先進單位”、“江西省文明單位”、“江西省衛生系統示范窗口單位”、“江西省十大和諧醫院”、“江西省省級群眾滿意醫院”等榮譽稱號。

　　一九五八年，贛南醫科大學第一附屬醫院僅是校園內一所能診治內科、兒科、外科、五官科疾病的極其簡陋的門診部。一九六二年，門診大樓建成，成立贛南醫學?？茖W校附屬門診部，遷入贛州市青年路現院址，為科級機構，隸屬學校和贛州地區衛生局雙重領導，開設內科、外科、五官科、婦產科、皮膚科、兒科、化驗室、藥房等科室，未設立病床，有職工40名。一九六三年，經江西省衛生廳批準設病床40張，同年10月再增設病床40張。一九六四年，成立贛南醫學?？茖W校附屬醫院，設立床位102張。設內、外、婦、兒、五官、皮膚6個臨床科室，2個醫技科室，有職工百余人。一九六八年，改稱為贛州專區“六二六”衛生人員學習班，病床縮減為40張，職工90人。一九六九年，改為“六二六”衛生學校附屬醫院。一九七二年，更名為贛南衛生學校附屬醫院。床位增加至118張，職工130人。一九七四年，更名為贛南醫學?？茖W校附屬醫院，隸屬于贛南醫學?？茖W校和贛州地區衛生局領導。一九八五年，劃歸江西省衛生廳和贛南醫學?？茖W校領導，開設病床202張，職工220人，醫院級別由正科級機構升格為副縣級機構。一九八八年，學校升格為本科院校后，更名為贛南醫學院附屬醫院，床位增加至272張，職工296人，醫院級別由副縣級機構升格為正縣級機構。二〇〇五年五月，更名為贛南醫學院第一附屬醫院。二〇二三年十一月，教育部向江西省人民政府發送《教育部關于同意贛南醫學院更名為贛南醫科大學的函》，同意贛南醫學院更名為贛南醫科大學。醫院更名為贛南醫科大學第一附屬醫院。

　　一九九〇年九月，新病房大樓落成，有效改善了就醫環境。一九九六年，被江西省衛生廳評為“三級甲等醫院”。二〇〇一年，二期住院部工程竣工并投入使用。二〇〇四年，門診綜合大樓落成并投入使用。二〇〇九年，再次被江西省衛生廳評為“三級甲等醫院”。二〇一〇年，與贛州開發區簽訂建設醫院開發區分院協議，啟動黃金院區建設工作，院本部住院綜合大樓擴建工程同時動工。二〇一〇年，被江西省衛生廳列為贛州市治療兒童白血病、先天性心臟病的唯一免費救治定點醫院。至二〇一〇年，醫院實際開放病床數1053張。

　　至二〇二四年，現有職工3700余人，其中專業技術人員近3400人，高級職稱人員530余人，博士及博士后133人，在讀博士90余人，碩士990余人，博士研究生導師10名，碩士研究生導師215名。博士人才總數在醫療機構中位居全省第三、全市第一，打造了區域內醫學高端人才高地。有教育部高校麻醉學專業教指委委員1人，全國衛生系統先進工作者1人，獲“中國醫師獎”專家1人，全國衛生健康系統新冠肺炎疫情防控工作先進個人1人，享受國務院及省、市政府特殊津貼專家5人，入選省“贛鄱英才555工程”領軍人才培養計劃專家1人，省新世紀百千萬人才工程專家9人，青年井岡學者1人，省高校學科帶頭人4人，省高校中青年骨干教師17人，江西省科技廳主要學科和技術帶頭人培養計劃領軍人才2人、青年人才1人，江西省醫師優秀團隊1個，江西省醫師優秀個人2人，省衛健委有突出貢獻中青年專家6人，省衛生系統學術和技術帶頭人培養對象40人，江西省衛生人才服務團專家21人等。

　　學科建設初見成效，眼科學、外科學、影像醫學與核醫學是江西省高?！笆濉?、“十一五”重點學科，二〇〇九年，外科學被列為江西省碩士學位授予建設點，眼科學、影像與核醫學被列為支撐建設點。二〇一〇年，泌尿外科（尿路結石）被列為江西省醫學領先建設學科。胸心外科、泌尿外科、骨科、眼科、神經外科、麻醉科、心臟介入學、超聲診斷學被確定為贛州市醫學領先專業，上述學科診斷治療水平達到省內先進，部分研究領域達到國內先進水平。

　　近年來共承擔60余項國家自然科學基金項目，成為江西省會城市外承擔國基金項目最多的醫療機構。承擔了3項國家863計劃項目子課題、4項國家科技支撐計劃項目子課題，省部級科研項目150余項，市、廳級課題2000余項；獲國家科技進步二等獎1項；省部級科技獎一等獎1項、二等獎2項,三等獎14項，省社科優秀成果三等獎1項；省衛健委技術創新獎2項；省教育廳科技成果獎7項；贛州市科技進步獎47項。在《Lancet Oncology》、《European Urology》、《J.Hepatol》、《Nature Communications》等SCI收錄期刊發表論文600余篇，在國家中文核心期刊發表論文900余篇，出版教材和專著100余部；獲國家發明專利、實用新型專利100余項。

　　在國家衛健委公布的全國三級公立醫院績效考核評價中，連續四年保持A+水平，位列全國三級甲等綜合醫院前10%，江西省前三，為江西省會城市外最佳。DRG綜合排名全省第三、全市第一。是江西省現代醫院管理制度省級試點醫院及江西省人員總量管理試點醫院。

　　醫院不斷夯實硬件設施，大力打造智慧醫院。近年來，配備了全國省會城市外第一臺最新一代達芬奇Xi型手術機器人，高強度聚焦超聲腫瘤治療系統（海扶刀）、車載移動CT和PCR檢測儀、美國GE Infinia Hawkeye 4型SPECT、新一代3.0T核磁共振系統、256排512層CT、雙源光子CT等螺旋CT機、DSA、直線加速器等大批高精尖醫療設備，整體配套齊全，達國內同類醫院先進水平。醫院已建立以電子病歷為核心信息系統，成為了全市首家通過電子病歷四級、互聯互通成熟度測評四乙的醫院，是江西省首批互聯網醫院授牌單位，為患者提供了全流程的移動便捷服務、人性化的智慧病房醫療服務，構筑起國內先進的數字化醫院信息平臺。黃金院區建有直升機標準停機坪，是贛州市空地一體化緊急醫療救援中心、贛州市中心城區120急救直升機固定起降點。